Группа исследователей из США и Канады обнаружила доказательства наличия множества повторяющихся экспансий в геномах раковых опухолей человека. В своей работе, опубликованной в журнале Nature, группа описывает поиск повторяющихся расширений в опухолях человека в банках данных Международного консорциума ракового генома и группы The Cancer Genome Atlas.
Как отмечают исследователи, известно, что тандемные повторы (TR) в последовательностях ДНК вовлечены в более чем 50 наследственных заболеваний. И, как они также отмечают, большинство исследований, изучающих влияние того или иного TR, ограничено нейродегенеративными или неврологическими заболеваниями, не связанными с раком.
Тем не менее, некоторые предыдущие исследования показали, что некоторые мутации, как известно, происходят в коротких последовательностях ТР, что было связано с микросателлитной нестабильностью. В этой новой работе исследователи более подробно рассмотрели ассоциации между последовательностями TR в раковых опухолях.
Работа началась с поиска данных Международного консорциума генома рака и Атласа генома рака, в ходе которого были найдены соматические повторы в опухолевой ДНК более двух десятков видов рака. Исследователи обнаружили 160 повторяющихся экспансий повторов (rRE). Они отметили, что все из них, кроме пяти, были, вероятно, специфическими для подтипов рака, которые часто появляются в нескольких типах распространенных видов рака, таких как рак яичников, почек и легких.
Исследователи также провели полногеномное длинное и короткое секвенирование двух типов линий раковых клеток, которые они нашли в ходе первоначального поиска – они исследовали обе с помощью Expansion Hunter Denovo (EHdn) для измерения длины ТР. Это показало, что примерно 72% повторных экспансий в опухолевой ткани находились в длинных последовательностях.
Исследователи также отметили, что предыдущие исследования с молекулой, известной как Syn-TEF1, показали, что она уменьшает ТР при некоторых неврологических заболеваниях, что побудило их проверить ее использование в нескольких типах рака. Это привело к снижению пролиферации клеток. По их мнению, этот результат указывает на то, что другие молекулы или терапевтические средства, изначально предназначенные для лечения неврологических заболеваний с ассоциациями TR, могут помочь в лечении и некоторых видов рака.
Вот ещё на днях про вторсырье на http://vtorobzor.ru почитал, мне кажется это более чем интересная, важная и нужная для человека информация. Не верите, то тогда сами посмотрите.