Группа ученых из Гонконгского университета науки и технологий (HKUST) недавно сделала важное открытие, определив ряд потенциальных мишеней для вакцины против коронавируса SARS-CoV-2, предоставив важные ориентиры для руководства экспериментальными усилиями по разработке вакцины. против новой пневмонии (COVID-19), вызванной вирусом.
Как и SARS-CoV, который вызвал вспышку SARS (тяжелого острого респираторного синдрома) в 2003 году, SARS-CoV-2 принадлежит к тому же роду Betacoronavirus. Учитывая генетическое сходство между SARS-CoV-2 и SARS-CoV, команда использовала экспериментально определенные иммунологические данные для определения набора B-клеточных и Т-клеточных эпитопов, полученных от SARS-CoV, которые точно соответствуют SARS-CoV-2. Эпитопы – это биомаркеры, распознаваемые иммунной системой и запускающие действия против вируса. Поскольку мутации в идентифицированных эпитопах среди доступных генетических последовательностей SARS-CoV-2 не наблюдались, иммунное нацеливание на эти эпитопы потенциально может обеспечить защиту от новой пневмонии COVID-19.
Команда, возглавляемая специалистами по анализу данных проф. Мэттью Маккей и доктор. Ахмед Абдул Квадир ожидал, что их работа может помочь в проведении экспериментальных исследований по разработке эффективных вакцин против SARS-CoV-2.
Проф. Маккей подчеркнул, что "Несмотря на сходство между SARS-CoV и SARS-CoV-2, между ними существует генетическая вариация, и не очевидно, будут ли эпитопы, вызывающие иммунный ответ против SARS-CoV, вероятно, эффективными против SARS-CoV-2. Мы обнаружили, что только примерно 20% эпитопов SARS-CoV идентично картируются с SARS-CoV-2, и полагаем, что это многообещающие кандидаты."
"Для идентифицированных эпитопов Т-клеток мы также выполнили анализ охвата населения и определили набор эпитопов, которые, по оценкам, обеспечивают широкий охват во всем мире, а также в Китае" сказал доктор. Quadeer. Расчетный охват населения представляет собой процент людей в выбранной популяции, которые могут вызвать иммунный ответ хотя бы на один эпитоп из идентифицированного набора.
Проф. Маккей – профессор кафедры электроники & Компьютерная инженерия и химия & Биологическая инженерия; Доктор. Квадир – научный сотрудник кафедры электроники & Компьютерная инженерия. Их результаты были недавно опубликованы в научном журнале Viruses в этом месяце.
"Наша цель состояла в том, чтобы попытаться помочь на начальном этапе разработки вакцины, предоставив рекомендации по конкретным эпитопам, которые потенциально могут быть рассмотрены для включения в дизайн вакцины" Проф. Маккей добавил. "В более общем плане наша работа является частью глобальных усилий, направленных на извлечение выгоды из данных о COVID-19, которые стали доступными и быстро распространяются научным сообществом, чтобы понять этот новый вирус и разработать эффективные меры вмешательства."
В начале 2020 года в материковом Китае появилась вспышка SARS-CoV-2, которая быстро распространилась на более чем 30 стран по всему миру, заразив более 80000 человек и вызвав более 2600 смертей по состоянию на конец февраля 2020 года.