Исследовательские группы во главе с британскими учеными упорядочили весь геном двух смертельных случаев рака, злокачественной меланомы и рака легких, показывающего дляв первый раз почти все десятки тысяч мутаций в ДНК раковых клеток, происходящих во время целой жизни человека.Исследование было во главе с учеными из Института Wellcome Trust Sanger в Hinxton в Кембридже и появляется как два исследования, изданные онлайн вуспех в проблеме 16 декабря Природы.Рак ведет мутация, часть из которой ведет образ жизни: эти исследования помогают показать сколько.Например, возьмите курение табака: во всем мире это – главная связанная с образом жизни причина рака, потому что известны более чем 60 химикатов в табачном дымесвязывать с и видоизменять ДНК в наших камерах.
Приблизительно один миллион человек во всем мире умирает от рака легких каждый год, и почти все случаи связаны с курением.Исследователи нашли почти 23 000 мутаций в клетках рака легких, предположив, что для каждой пачки сигарет, типичный курильщик получает тумутация в его или ее ДНК.При раке легких учится геном, исследователи использовали мелкоклеточную клеточную линию рака легких от одного человека, и в исследовании генома меланомы они использовали aзлокачественная меланома и лимфобластная клеточная линия от другого человека.
Геном меланомы показал еще больше мутаций: более чем 30 000 всего, давая отчету как и когда пациент получил их.Несмотря на то, что злокачественная меланома только составляет 3 процента рака кожи, это вызывает 75 процентов смертельных случаев от рака кожи.Профессор Майк Стрэттон, из Проекта Генома Рака в Институте Wellcome Trust Sanger и соавтора обоих исследований, сказал прессу что:«Это два главных случая рака в развитом мире, для которого мы знаем основное выделение».«Для рака легких это – папиросный дым, и для злокачественной меланомы это – выделение к солнечному свету», добавил он, объяснив что:«С этими последовательностями генома мы были в состоянии исследовать глубоко в прошлое каждой опухоли, раскрывающей с замечательной ясностью отпечаткиэти экологические мутагены на ДНК, произошедшей за годы до опухоли, стали очевидными."
В довольно остром наблюдении Стрэттон описал, как он и его команда могли также видеть:«Отчаянные попытки нашего генома защитить себя от повреждения, которому дают выход химикаты в сигарете, курят или повреждение отультрафиолетовое излучение."«Наши камеры сопротивляются неистово, чтобы возместить убытки, но часто проигрывать», добавил он.Для двух исследований Стрэттон и коллеги использовали сильные новые технологии упорядочивания ДНК, чтобы расшифровать полностью геном обеих опухолейткань и нормальная ткань.Они тогда сравнили последовательности генома каждого из раковых образований к той из соответствующей здоровой ткани и выбрали определенное для ракаизменения.
В заявлении для прессы от Wellcome Trust было сказано, что эти исследования:«Первое, чтобы написать всесторонние описания всего генома всех классов мутации, производя богатые счета генетических изменений вразвитие этих двух случаев рака."Доктор Энди Фатрил из Института Wellcome Trust Sanger и другой соавтор обоих исследований, сказали:«В образце меланомы мы видим подпись солнечного света, очевидную в геноме».Но он сказал, потому что они упорядочили то, что было чрезвычайно полными каталогами мутаций при обоих случаях рака, они могли также видеть другой «большетаинственные процессы, действующие на ДНК», включая то, что они подозревают, чтобы быть мутациями, фактически заставляющими клетки становиться злокачественными.
Мы уже знаем, что только некоторые мутации, найденные при раке фактически, вызывают рост рака, другие часто описываются как «пассажиры».Разыскивание мутаций, ведущих рак, будет их основной проблемой в течение следующих нескольких лет, сказал Фатрил.Доктор Питер Кэмпбелл, который также создал в соавторстве оба исследования и является также от Института Wellcome Trust Sanger, сказал, что мы провели прошлые 10 летпри получении выгоды упорядочивания всего генома человека, и существует все еще большая работа, чтобы сделать на геномах рака, но:«Знание, которое мы извлекаем за следующие несколько лет, будет иметь серьезные последствия для лечения».«Путем идентификации всех генов рака мы будем в состоянии разработать новые лекарства, предназначающиеся для определенных видоизмененных генов и удающиеся, какие пациенты будутпреимущество от этого нового лечения», сказал Кэмпбелл.
Идея состоит в том, что это будет однажды он не только быть возможным, но также и экономически эффективным, чтобы картировать весь геном каждого больного раком и таким образом выбрать и прямое лечение специфично дляотдельный пациент.Исследование позади этих двух исследований является частью Международного Консорциума Генома Рака, конечная цель которого должна упорядочить геномы более чем 100 отличающихсятипы рака, с помощью модели проекта генома человека скоординировать геном рака, упорядочивающий в мировом масштабе.В конечном счете это приведет к каталогу мутаций через широкий спектр и широкий диапазон типов рака, и даст исследователям, практикам, всем нам,лучшие способы понять, предотвратить, обнаруживая и леча рак.
«Мелкоклеточный геном рака легких со сложными подписями выделения табака».Эрин Д. Плезенс, Филип Дж. Стивенс, Сара О’Мира, Дэвид Дж. Макбрайд, Элисон Меинерт, Дэвид Джонс, Meng-кладет Лин, Дэвида Бира, короля Вай Ло,
Крис Гринмен, Игнасио Варела, Серена Ник-Зайнал, Хелен Р. Дэвис, Гонсало Р. Ордоньес, Лора Дж. Муди, Калли Латимер, Сара Эдкинс, Люси
Стеббингс, Лина Чен, Минмин Цзя, Кэтрин Лерой, Джон Маршалл, Эндрю Мензис, Адам Батлер, Джон В. Тигу, Джонатон Манджион, YongmingA. Солнце, Стивен Ф. Маклафлин, Хизер Э. Пекхэм, Эрик Ф. Цзун, Хина Л. Коста, Кларенс К. Ли, Джон Д. Минна, Adi Gazdar, Иван Бирни,Майкл Д. Родс, Кевин Дж.
Маккернэн, Майкл Р. Стрэттон, P. Andrew Futreal & Peter J. Кэмпбелл.Природа,
Передовая онлайновая публикация, 16 декабря 09.DOI:10.1038/nature08629«Всесторонний каталог соматических мутаций от человеческого генома рака».Эрин Д. Плезенс, Р. Кира Чеезэм, Филип Дж.
Стивенс, Дэвид Дж. Макбрайд, Шон Дж.
Хумфрей, Крис Д. Гринмен, Игнасио Варела, Meng-кладет Лин,Гонсало Р. Ордоньес, Грэм Р. Бигнелл, Кай Вы, Джули Алипэз, Маркус Дж.
Бауэр, Дэвид Бир, Адам Батлер, Ричард Дж. Картер, Лина Чен, Энтони Дж.Кокс, Сара Эдкинс, Паула И. Кокко-Гонсалес, Найэл А. Гормли, Руссель Дж.
Грокок, Кристиан Д. Ходеншилд, Мэтью М. Химс, Терена Джеймс,Минмин Цзя, Зоя Кингсбуры, Кэтрин Лерой, Джон Маршалл, Эндрю Мензис, Лора Дж. Муди, Цзэминь Нин, Том Ройс, Оле Б. Шульц-Триглафф,
Anastassia Spiridou, Люси А. Стеббингс, Лукасз Сзайковский, Джон Тигу, Дэвид Уильямсон, Линда Чин, Марк Т. Росс, Питер Дж. Кэмпбелл, Дэвид Р.
Бентли, P. Andrew Futreal & Michael R. Стрэттон.Природа,Передовая онлайновая публикация, 16 декабря 09.DOI:10.1038/nature08658
Источник: Wellcome Trust.