BGI в сотрудничестве с Институтом биофизики Китайской академии наук и другими китайскими институтами завершили секвенирование генома 161 Mycobacterium tuberculosis, которая может вызывать инфекционное заболевание туберкулезом (ТБ). Исследование, опубликованное в Интернете в Nature Genetics, предоставляет исследователям бесценный ресурс, позволяющий лучше понять генетическую основу, лежащую в основе ТБ с лекарственной устойчивостью.
Туберкулез – одно из самых смертоносных инфекционных заболеваний. По оценкам Всемирной организации здравоохранения, треть населения мира инфицирована M. туберкулез. Хотя усилия по борьбе с туберкулезом обнадеживают 1.Ежегодно с 2002 года заболеваемость туберкулезом во всем мире снижается на 3%, лекарственно-устойчивый туберкулез по-прежнему представляет собой серьезную и растущую глобальную проблему для лечения. Лекарственная устойчивость особенно остра в Китае, где 5.7% новых случаев ТБ имеют множественную лекарственную устойчивость (МЛУ), а 8% случаев МЛУ имеют широкую лекарственную устойчивость (ШЛУ).
Чтобы понять механизм устойчивости к лекарствам на уровне ДНК, китайские исследователи провели всестороннее исследование всего генома 161 M. туберкулезные штаммы с широким диапазоном профилей устойчивости (44 лекарственно-чувствительных, 94 МЛУ и 23 изолята ШЛУ). В общей сложности они обнаружили 72 новых гена, 28 межгенных областей (IGR), 11 несинонимичных SNP и 10 SNP IGR с сильными, последовательными ассоциациями с лекарственной устойчивостью.
Исследователи обнаружили, что генетическая основа лекарственной устойчивости более сложна, чем предполагалось ранее. Идентификация новых генов, связанных с лекарственной устойчивостью, IGR и SNP обеспечивает почти полный набор генов для изучения лекарственной устойчивости ТБ. Эти результаты закладывают прочную основу для глубокого исследования механизмов лекарственной устойчивости как у M. туберкулез и другие бактериальные патогены, леченные теми же схемами антибиотиков.
Дунфан Ли, менеджер проекта из BGI, сказал:, "Лекарственная устойчивость M. туберкулез – очень серьезная проблема, особенно в Китае. Мы ожидаем, что наш прорыв может пролить новый свет на изучение механизмов лекарственной устойчивости и заложить прочную основу для борьбы с туберкулезом и защиты от него."