Следователи развили важную мышь генетический проект, который ускорит будущее исследование и понимание человеческой генетики. В двух статьях, опубликованных по своей природе 14 сентября, международные команды, во главе со следователями в Институте Wellcome Trust Sanger и Оксфордском университете, объясняют, как они взломали и оценили последовательность генома 17 штаммов мыши.В создании этого проекта, самого большого ресурса для любого позвоночного организма модели, они обнаружили удивительные 56,7 миллионов уникальные места изменения (известный как SNPs) между штаммами, а также другими более осложненными различиями.
Среди них они идентифицировали различия в последовательности, связанные больше чем с 700 биологическими различиями, включая маркеры для болезней – таких как диабет и болезнь сердца, таким образом соединив гены с с медицинской точки зрения важными индивидуальными различиями.В основном финансируемый Советом по медицинским исследованиям и Wellcome Trust, проект может использоваться следователями, чтобы понять генетическое основание отдельного изменения и задать важные вопросы относительно того, как работают гены и как гены увеличивают или уменьшают возможности того, что мы имели определенные болезни.Врожденные штаммы мышей являются жизненным источником генетической информации.
Каждая врожденная мышь по существу генетически идентична, но каждая мышь отличается и в их генах и через широкий спектр с медицинской точки зрения и биологически особенности важности.Доктор Адамс, от Института Wellcome Trust Sanger, приведшего проект, объяснил:«Мы живем в эру, где у нас есть тысячи геномов человека в наших кончиках пальцев.
Мышь и последовательности генома, которые мы генерировали, будут играть важную роль в понимании того, как наследственная изменчивость способствует болезни и приведет нас к новым методам лечения».При помощи этого проекта следователи не должны будут полагаться так же на размножающихся мышей, чтобы найти мутации, они будут в состоянии найти мутации при намного более быстром уровне путем поиска данных по их компьютеру.Эти мыши используются во всех областях биологии, чтобы увеличить наше понимание человеческой болезни, и существует значительно больше, чтобы обнаружить.
С вариантами, чтобы вручить, задача двигается в понимание биологических последствий.Доктор Томас Кин, который был первым автором на одном из отчетов, сказал:«В некоторых случаях потребовалось 40 лет, весь срок службы, чтобы придавить ген в модели мыши, связанной с человеческой болезнью, ища причину.
Теперь с нашим каталогом вариантов анализ этих мышей захватывающе дух быстр и может быть закончен во время, которое требуется, чтобы сделать чашку кофе.Теперь мы знаем, где все варианты, таким образом, вопросы сегодня – то, что они делают, и мы можем объяснить фенотипические различия между различными штаммами мышей?»
Значительно, сумма разведения мышей и тестирования, требуемого идентифицировать гены и мутации, будет уменьшена благодаря каталогу, который уменьшит мышей, необходимых для каждого расследования. Первое открытие может быть сделано на компьютере. Этот всесторонний проект будет жизненно важен для соединения изменения в черте с изменениями ДНК – поездка биолога от фенотипа до генотипа.
Используя последовательность 17 геномов мыши, они искали изменения, связанные с количественными очагами черты (QTLs) вовлечение различий в последовательности между штаммами, как связываемыми с фенотипами, отличающими их.Профессор Джонатан Флинт, от Центра Wellcome Trust Человеческой Генетики, кто co-led расследование, объяснил:«Это исследование является первым шагом в длинном пути, перемещающем от понимания, каков геном, к тому, что это делает».Профессор Иэн Джексон, объединенный глава Медицинских и Генетики развития в Человеческом Отделении Генетики Совета по медицинским исследованиям, сказал:«Биологические различия через врожденные штаммы изменения модели мышей между отдельными людьми. Этот ресурс, сделанный возможным через огромные недавние успехи в упорядочивании технологии, преобразовывает наше понимание того, как изменение последовательности ДНК касается функции гена, и в конечном счете связано с биологией и здоровьем человека».
Проект будет удлинен путем упорядочивания дополнительных штаммов мыши, определения генетических изменений в раковых образованиях мыши и исследования эффекта вариантов на функции гена.Каталог, объединенный с сегодняшним быстрее упорядочивание, позволяет следователям оказываться более глубокими, чтобы обнаружить мутации, влияющие на функцию гена намного больше быстрее.
В дополнение к открытию двери в возможность упорядочивания значительно больших количеств мышей, с планами расширить проект на сотни штаммов мыши, миссия, которая всего несколько лет назад казалась бы невозможной.