Намного больше нашего генома биологически активно, чем ранее мысль – приблизительно 80% – международная команда, вовлекающая более чем 400 ученых вчера, показала. Исследователи объяснили, что только приблизительно 1% нашего генома имеет генные области, кодирующие для белков, который заставил их задаться вопросом, что продолжает остальную часть ДНК. Теперь, когда мы знаем, что четыре пятых генома биохимически активны в пути, регулирующем выражение соседних генов, генетики понимают, что так намного меньше нашего генома состоит из ДНК барахла, как когда-то верится.9Эксперты полагают, что эти новые результаты исследования помогут нам лучше понять, как несколько болезней развиваются и ведут себя, который может привести к более эффективному и предназначенному лечению.
Геном человека имеет вдвое больше генов, чем ранее мысль. Многие ранее неизвестные гены играют роль в клеточном контроле, который может повлиять на развитии человеческих болезней.Международный консорциум ученых проанализировал и экспериментировал на упорядочивании данных от 140 различных типов клеток человека и идентифицировал тысячи областей ДНК, помогающих направить действия наших генов.
Мэнолис Келлис, адъюнкт-профессор информатики в MIT, и соавтор отчета, появившегося в нескольких научных журналах, включая Природу, сказал:«Люди на 99,9 процентов идентичны друг другу, и у Вас только есть одно различие в каждых 300 – 1 000 нуклеотидов. То, что КОДИРУЕТ, позволяет, Вы, чтобы сделать, предоставляют аннотацию того, что делает каждый нуклеотид генома, так, чтобы, когда это видоизменено, мы могли сделать некоторые прогнозы о последствиях мутации».Что, КОДИРУЮТ?ЗАКОДИРУЙТЕ (Энциклопедия Элементов ДНК) общественный конгломерат исследования, начатый NHGRI (Национальный Научно-исследовательский институт Генома человека) в США и EMBL-европейском Институте Биоинформатики (EMBL-EBI) в Великобритании, в 2003.
Его цель состоит в том, чтобы идентифицировать все функциональные компоненты генома человека. NHGRI и EMBL-EBI обязались выпускать все данные проекта немедленно в общественные базы данных.То, какие ученые первоначально думали, было ДНК барахла, фактически биохимически активно.Одна из целей КОДИРУЕТ, должен был лучше понять геном человека вне кодирующих белок генов.
Ученые могут сделать это путем исследования химических реакций, происходящих в отдельных отрезках ДНК – эти отрезки контроль, когда определенные генетические области становятся активными. Химические модификации варьируются типом клетки и могут изменить ДНК непосредственно, или просто белки гистона, которые окружает ДНК.
Пилотный проект был издан в 2007, который посмотрел на 1% генома человека.Чтобы картировать эти эпигеномы (модификации), исследователи собрали данные из различных типов клетки.
В то время как некоторые лаборатории измерили модификации гистона ДНК, другие измерили доступность различных отрезков ДНК путем сокращения их во фрагменты с ферментами.ЗАКОДИРУЙТЕ сотрудничество 442 ученых из 32 лабораторий в Японии, Сингапуре, Испании, США и Великобритании. Вместе, они генерировали и исследовали более чем 15 терабайт исходных данных – все эти данные теперь общедоступны.
Они использовали ценность приблизительно 300 лет машинного времени, сосредотачивающегося на 147 типах ткани, чтобы узнать то, что включает определенные гены и прочь, и определенные особенности выключателей в различных типах клетки.ЗАКОДИРОВАТЬ ученые нашли, что приблизительно 80% генома человека вовлечены в некоторый тип биохимического события, такого как белковое связывание, специфично связав с белками, влияющими о том, как используются соседние гены. Они также нашли, что те же самые регулирующие области имеют различные роли, чтобы играть, в зависимости от того, в какой клетке они действуют.Ученые проанализировали сохранение A, T, C и нуклеотидов G в новых регулирующих областях, которые они идентифицировали.
Нуклеотиды сохраняются, если они остаются то же за длительные периоды во время нашего развития. Это может быть исследовано или сравнением, как изменения происходят между различными разновидностями, или среди людей тех же разновидностей.В онлайновом коммюнике, европейском Институте Биоинформатики, написал:«5 сентября, международная команда исследователей показывают так большую часть того, что назвали ‘ДНК барахла’ в геноме человека, фактически крупный пульт управления с миллионами выключателей, регулирующих активность наших генов. Без этих выключателей гены не работали бы – и мутации в этих областях могли бы привести к человеческой болезни».
Три миллиарда пар генетического кодаДо сих пор все три миллиарда пар генетического кода, составляющих ДНК человека, были проанализированы, КОДИРУЮТ. Ученые из европейского Института Биоинформатики объяснили, что они идентифицировали функцию генома 4 миллионов генных выключателей, которые помогут исследователям заточить – в на определенных областях человеческой болезни, и надо надеяться найти способы лучше лечить или вылечить их.
Они добавили, что выключатели часто являются длинным путем вдоль генома от гена, который они регулируют.Иван Бирни из европейского Института Биоинформатики, ведущий аналитический координатор для КОДИРУЕТ, сказал: «Наш геном просто изобилует выключателями: миллионы мест, определяющих, включен ли ген или прочь. Проект генома человека показал, что только 2% генома содержат гены, инструкции сделать белки. С КОДИРУЮТ, мы видим, что приблизительно 80% генома активно делают что-то.
Мы нашли, что намного большая часть генома – удивительной суммы, фактически – вовлечена в контролирование, когда и где белки производятся, чем в простом производстве стандартных блоков».Иэн Данэм, также европейского Института Биоинформатики, сказал, что это КОДИРУЕТ, полезный инструмент исследования для любого исследователя, изучающего человеческие болезни. У ученых, расследующих болезни часто, есть хорошая идея, о которой гены включаются, но нуждаются в данных, на которых выключатели играют роль.
В некоторых случаях местоположения этих выключателей не то, где они ожидали, что они будут. Данэм сказал, «КОДИРУЮТ, дает нам, ряд очень ценного ведет, чтобы следовать, чтобы обнаружить ключевые механизмы в действии в здоровье и болезни.
Те могут эксплуатироваться, чтобы создать совершенно новые лекарства или повторно иметь целью существующее лечение».Научный руководитель на КОДИРУЕТ, доктор Майкл Снайдер, преподаватель и стул в Стэнфордском университете, объяснили, что КОДИРУЮТ, предоставляет нам знание, требуемое так, чтобы мы могли на время забыть линейную структуру генома к тому, как целая сеть связана. Исследования ассоциации всего генома помогают нам понять, где определенные гены расположены, а также какие последовательности управляют ими. Снайдер сказал «Из-за сложной, трехмерной формы нашего генома, те контрольные группы иногда далеки от гена, который они регулируют и перекручивающийся вокруг, чтобы вступить в контакт.
Были это не для КОДИРУЕТ, мы никогда, возможно, не смотрели в тех областях. Это – существенный шаг к пониманию схемы соединений человека. ЗАКОДИРУЙТЕ помогает нам глубоко изучить регулирующую схему, говорящую нам, как все части объединяются, чтобы сделать комплекс быть».
Прежде, генерируя и храня огромные объемы данных была проблема в биомедицинском исследовании. Однако, поскольку производительность упорядочивания генома улучшилась и стала более экономичной, центр двинулся в анализ, т.е. данные об интерпретации, сгенерированные от исследований ассоциации всего генома. Кембриджские университетские ученые сказали, «КОДИРУЮТ партнеров, работали систематически через геном человека, с помощью тех же вычислительных методов и методов влажной лаборатории и реактивов в лабораториях, распределенных во всем мире».
Иван Бирни сказал:«Получение лучших людей с лучшими экспертными знаниями вместе – то, о чем это – все. ЗАКОДИРУЙТЕ действительно показал, что ведущие биологи очень хороши в сотрудничестве близко в крупном масштабе, чтобы произвести превосходные основополагающие ресурсы, которые может использовать целое сообщество».
Ученые подчеркнули, что это будет за несколько лет до того, как врачи и пациенты видят, что любые материальные преимущества от КОДИРУЮТ.