‘Мертвые точки’ в ДНК могут скрыть гены рака

мочь

Несмотря на то, что читающая ген технология продвинута и сложна,существуют определенные части ДНК, с которой это не справляется отлично;например, существуют повторяющиеся области ДНК, вызывающие машинное оборудование«заикаться». Но существует способ исследовать эти «мертвые точки» иузнайте, скрывают ли они гены рака.

Исследователи использовали две огромных генных базы данных рака, чтобы определить местонахождение мертвых точек в ДНК, которая может содержать вызывающие рак гены.Это было заключением нового исследования Cancer Research U.K.ученые, работающие в Манчестерском университете в Великобритании, ктосообщите об их результатах исследования в журнале Cancer Research.

Команда нашла больше чем 400 мертвых точек в ДНК, которая могла бытьпредоставление крова вызывающим рак генным ошибкам, как ведущий исследователь Эндрю Хадсон,клинический коллега в Институте Cancer Research U.K. Манчестеробъясняет:«Гены позади рака походят на историю. В то время как мы были в состояниипрочитайте большую часть книги с помощью читающей ген технологии, пределовэти инструменты означают, что некоторые страницы отсутствуют."«Эти страницы могли просто быть неважным наполнителем», он добавляет, «но интересно если онимог бы держать важные повороты в участке, который мог влиять на нашпонимание рака.

Следующий шаг в нашей работе должен будет найти aспособ открыть эти области, чтобы помочь соединить полную историю."Команда сравнила две огромных генных базы данных ракаЧтобы искать «недостающие страницы», команда сравнила два видных ракабазы данных упорядочивания генома, получившие их информацию от исследованийвыращенные лабораторией раковые клетки, и они перепроверили все гены, которые известныили подозреваемый быть вовлеченным в рак, чтобы определить местонахождение любых несоответствий.Эти две базы данных, которые они использовали, являются CCLE, Энциклопедией Линии раковых клеток и КОСМИЧЕСКИЙ, Каталог Соматических мутаций вРак.

Они пишут, как их анализ «показал отмеченные несоответствия вобнаружение мутаций с изменением смысла в идентичных клеточных линиях (57,38%соответствие)», и они отмечают что главная причина для несоответствия«несоответствующее упорядочивание богатых GC областей».Другими словами, для определенных областей ДНК, было более чем 40%несоответствие в кодовой последовательности, данной этими двумя базами данных, даже при том, чтоинформация прибыла из идентичных клеточных линий.

Авторы отмечают ихнесоответствия произошли в «богатых GC» областях ДНК. GC обозначает гуанини цитозин, два из четырех стандартных блоков ДНК.Кроме того, как «доказательство принципа», чтобы показать, что это стоит посмотретьболее близко в мертвых точках для новых водителей рака, командысосредоточенный на недавно идентифицированной мутации в гене PAK4. Они показалито «определенное планирование и упорядочивание» богатых GC мертвых точек«может привести к идентификации новых мутаций водителя в известномсупрессоры опухоли и онкогены."

Они приходят к заключению, что их исследование показывает путем поперечной ссылки междугенные базы данных обычно используемых клеточных линий, возможно обнаружитьновые водители рака – путем взгляда в плохо упорядоченных областях.’Копаясь глубже в генетическом происхождении рака, чтобы найти болезньспусковые механизмыНелл Барри, старший научный информационный менеджер для Исследований рака

Великобритания заявляет:«Путем копания глубже в генетическом происхождении рака мы можем определитьпутями болезнь вызвана и развивается. Это могло помочь нам кзаймитесь им от корня, дав большему количеству больных раком шанс ввыживание болезни."В октябре 2014, изученный, как пониманиев какхромосомы копии клеток могли бытьважный для борьбы с раком.

Команда исследователей обнаружила есликомпонент для раскручивания нитей ДНК остается интактным после хромосомыкопирование завершено, оно может играть опустошение с клеточным делением, известнымспусковой механизм для рака.


PHOTOINTERVIEW.RU